De nombreuses interférences chimiques peuvent avoir lieu lors de l'atomisation. Celle-ci sera plus ou moins efficace selon la nature de l'anion.
Afin d'améliorer les mesures, on ajoute à la solution un sel facilement ionisable en quantité suffisante pour rendre constante la pression électronique dans la flamme.
Na → Na+ + e-
La constante d'équilibre d'ionisation kNa+ = (PNa+Pe-)/PNa
D'où le taux de ionisation: P Na=/PNa =KNa/Pe-
Il va dépendre donc de la quantité de la Pe- qui peut être modifiée en présence d'interférent tel que le potassium.
Pour éviter ces interférences, on ajoute en grande quantité un sel facilement ionisable. On utilise généralement du chlorure de Césium. La concentration en Cs étant largement supérieure à celle du Na à doser et de l'interférent K, la Pe- sera quasiment égale à PCs+. Le taux de ionisation PNa=/PNa =KNa/Pe- devient donc constant.